2003. május 2-án jelent meg a 3. generációs iPod, amely sok szempontból egy furcsa modell volt, de pont emiatt rengeteg rajongónak a mai napig ez a kedvence. Tárhely tekintetében nagy választékot kínált, a felhasználók 10, 15, 20, 30 és 40 GB háttértárral is megvásárolhatták a készüléket, az összes korábbi és későbbi iPod általában 2-3 különféle kapacitással érkezett, míg az első Mini és az utolsó Shuffle csak egyféle méretű tárhellyel volt elérhető. A kezelőfelületet a korábbi modellekhez képest teljesen átrendezték, a körben elhelyezett gombok helyett egy érintőtárcsát kapott, amely fölött négy darab, piros háttérvilágítással rendelkező gomb kapott helyet: ez vezetett egy évvel később az iPod Minivel debütáló, sokáig használt Click Wheel megoldáshoz, amelyet pár hónappal később a 4. generációs iPod is átvett, illetve az már USB-n keresztül is tölthető volt.

Az AppleDemo YouTube csatorna hozzájutott egy 3. generációs prototípushoz, amely első ránézésre akár egy végleges modellnek is tűnhet, de a tárkapacitást jelző felirat helyén a DVT kifejezés olvasható. Ez az angol Design Validation Testing betűszava, tehát a dizájn véglegesítéséhez használatos, nem túl korai prototípusról van szó, amely a végleges termékeknél sosem használt A1023-as modellszámot kapta, illetve speciális soros interfésszel rendelkezett, amelyet az Apple mérnökei tudtak használni. Az iPodOS 2.0 operációs rendszer prototípusát futtató eszköz Apple történeti szempontból azért nagyon különleges, mert egy soha meg nem jelent iPod-játék is helyet kapott rajta: ez a Stacker nevű Tetris-klón. A YouTube csatorna tulajdonosa megkérdezte az iPodok keresztapjaként is ismert Tony Fadellt, hogy a játék miért nem volt elérhető a végleges változatokon, amire egy kicsit kitérő válasz érkezett: azért, mert a játékok csak egy későbbi frissítéssel érkeztek meg. Ez tény, később a 3. generációs iPodon négy játék volt futtatható (Brick, Solitaire, Parachute, Music Quiz), a későbbi iPodokra pedig akár az iTunes-on keresztül is lehetett játékokat vásárolni, többek között az eredeti Tetrist is. Az alábbi videón viszont több mint 20 évvel később mindenki megnézheti, hogy milyen volt a Stacker működés közben.